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富集分析条形图

GO、KO、DO、Reactome富集分析结果绘制条形图

10

3

显著性标记箱线图(多组)

多组样本间两两进行T检验和秩和检验,绘制箱线图,显著差异的组间标注显著线

5

6

显著性标记箱线图(两组)

两组样本间进行T检验和秩和检验,绘制箱线图,两组间显著差异的箱线图标注显著线

5

3

tSNE

通过非线性降维模型将多个样本投影至二维平面展示,暂不支持单细胞数据降维

5

4

断轴柱状图

用一个带有表头的的表格数据绘制一个断轴柱状图。

5

2

显著性标记柱形图(多组)

多组样本间两两进行T检验和秩和检验,显著差异的组间标注显著线

5

11

显著性标记柱形图(两组)

两组样本间进行T检验和秩和检验,显著差异的组间标注显著线

5

6

三元图

用一个带有表头的表格数据绘制一个三元图。

10

12

plantTFdb注释

对目标序列进行plantTFdb数据库注释,寻找潜在的转录因子

3000

11

CAZy注释

比对Pfam数据库进行注释

3000

7

Pfam注释

比对Pfam数据库进行注释

3000

13

eggNOG注释

对目标序列进行eggNOG数据库注释并统计。

3000

5

KOG注释

对目标序列进行KOG数据库注释并统计。

3000

9

COG注释

对目标序列进行COG数据库注释并统计。

3000

11

细菌抗性基因(CARD)注释

对细菌基因组进行CARD数据库耐药基因注释

3000

3

细菌致病菌毒力因子(VFDB)注释

用于致病细菌、衣原体和支原体的致病因子注释

3000

5

细菌抗性基因(ARDB)注释

可对细菌的耐药蛋白进行注释

3000

3

NR注释

将目标序列比对注释到NR数据库

3000

12

KEGG功能注释

将目标序列注释到KEGG数据库

3000

33

GO功能注释

将目标序列比对注释到GO数据库

3000

39

PHI注释

对序列进行PHI数据库注释并统计。

3000

10

AnimalTFDB注释

对目标序列进行动物转录因子数据库的注释

3000

2

Swiss-Prot注释

将目标序列比对到Swiss-Prot数据库

3000

10

UpSet维恩图

用来显示数据元素重叠区域

8

39

动态PCoA分析

可个性化筛选数据,并获得物种分类和OTU水平的样本距离,以PCoA和热图直观展示。

20

48

动态KEGG富集分析

利用统计检验寻找富集KO功能,并通过图表交互形式对结果进行动态分析。

20

166

秩和检验

进行两组样本的差异分析,使用R语言进行t检验

3

19

circos物种关系图

将物种分组和丰度信息以circos图展示

5

83

动态GO富集分析

利用统计检验寻找富集GO功能,并通过图表交互形式对结果进行动态分析。

20

204

t检验

进行两组样本的差异分析,使用R语言进行t检验

5

67

分组小提琴图

利用N个表格数据绘制分组小提琴图

5

43

九象限图

转录组与蛋白组关联分析

5

37

组间相关性分析

组间相关性分析及热图展示

3

99

组内相关性分析

组内相关性分析及热图展示

3

91

小提琴图

将表格数据绘制成一个小提琴图

5

86

CCA/RDA

计算并展示环境因子、微生物群落和样本关系

3

59

ROC

ROC曲线用来评价一个二值分类器(如生物标记物)的优劣

3

50

NMDS

非线性模型将样本距离进行降维展示

5

95

PCoA

线性模型将样本距离进行降维展示

5

134

(O)PLS-DA

利用(O)PLS-DA分析,计算两个分组的差异物质(如代谢物)

5

181

fq2fa

把fastq文件转换为fasta文件

0

46

GO分类柱状图

绘制一组或多组数据的GO二级分类注释柱状图

5

191

解读SAM flag

解读SAM flag

0

32

饼图

将表格数据绘制成一个饼图

0

118

3D散点图

将表格数据绘制成一个3D散点图

2

83

线性回归图

将表格数据绘制成包含趋势线的散点图

0

98

权重网络图

一款图形化显示权重网络并进行分析和编辑的软件

5

136

edgeR差异分析

用edgeR计算两组样本之间差异表达的基因

10

319

三维PCA

将多个变量通过线性变换,筛选出数个比较重要的变量,用3D形式展示出来

5

168

高级散点图

将表格数据绘制成一个可包含辅助线和相关系数的散点图

5

126

COG/KOG图

根据基因的COG/KOG ID或COG/KOG code绘制柱状统计图

5

141

高级气泡图

KEGG富集分析结果的可视化

5

441

SVG转换

将SVG格式转换成其它常用格式

0

87

Krona层级饼图

在清楚看到层级关系的情况下,动态展示各部分所占比例

3

54

MA图

用两组样品间的差异基因绘制MA图

3

110

火山图

用两组样品间的差异基因绘制火山图

3

395

有向网络图

一款图形化显示有向网络并进行分析和编辑的软件

5

148

GO富集分析

应用超几何检验,找出与整个基因组背景相比,在差异表达基因中显著富集的GO条目

10

707

KEGG富集分析

应用超几何检验,找出与整个基因组背景相比,在差异表达基因中显著性富集的Pathway

10

712

趋势分析图

可以找到具有相同表达模式的基因

10

345

维恩图

用来显示数据元素重叠区域

5

617

热图

将表格数据绘制成一个热图

5

992

气泡图

将表格数据绘制成一个气泡图

3

170

盒型图

将表格数据绘制成一个盒形图

3

211

面积图

将表格数据绘制成一个面积图

3

47

频率直方图

将表格数据绘制成一个频率直方图

3

77

柱状图

将表格数据绘制成一个柱状图

3

116

折线图

将表格数据绘制成一个折线图

2

102

散点图

将表格数据绘制成一个散点图

3

116

分层聚类分析(hca)

根据不同的类或簇之间的相似性与差异性,进行分类

3

246

PCA

将多个变量通过线性变换,筛选出数个比较重要的变量。

5

426

muscle多序列比对

多序列比对工具

2

72

Blast序列局部比对

原始序列和目标序列来进行Blast序列比对,并输出比对结果

2

99

CDS转蛋白

把CDS fasta序列转换成蛋白序列

2

61

DNA/RNA转换器

实现DNA与RNA互相转换

2

46

截取序列

截取序列的指定区段,分为单区段序列截取和多区段序列截取两种模式

1

59

序列长度过滤

筛选特定长度的范围的序列

2

53

序列长度统计

统计所有序列的长度

2

60

序列格式化

设置碱基或氨基酸数量,描述信息保留与否、是否转为小写、获取反向互补序列

2

42

表格筛选

筛选关注的表格信息

2

203

表格转置

将表格中的行与列互换

0

107

多表格合并

将多个表格合并成一个表格

2

139

两表格合并

将两个表格合并成一个表格

0

211