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[转录组] 畅享新时代转录组研究方案,获终身免费分析机会

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    发表于 2020.2.28 09:46:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
    转录组测序因其便宜好用已经成为最为常规的测序手段。随着技术的大量使用,测序数据量和样本数的增加已经成为趋势,这使转录组数据的处理需要更为高效的方案。分析软件的准确与便捷、图形呈现的美观度、数据挖掘的个性化已经成为新时代转录组研究的三大需求。

    根据这一市场特点,基迪奥经过大量研发并全面更新了转录组分析内容,推出本地报告与动态在线报告相结合的解决方案,从而帮助客户快速实现复杂转录组数据的个性挖掘。

    新时代转录组测序研究的诉求及基迪奥解决方案

    1. 流程:更准确的软件、更完善的分析内容、更丰富的数据库

    比对参考基因组,转录本重构和差异分析为转录组分析的核心内容。传统Tophat + Cuflink + edgeR的分析策略会带来数据分析速度慢,比对率偏低,转录组重构和定量不够准确,差异分析选择性少等问题。

    针对这些旧流程带来的问题,我们重新研发出Hisat2 + Stringtie + Deseq2/edgeR的分析思路,能够快速缩短分析流程到1天之内,并从结果来看,也极大提高数据的分析准确性,这使得转录组的分析更为便捷高效。

    与此同时,在功能研究上面,我们新加入了GSEA分析,弥补了以前由于差异分析结果的偏差可能造成富集分析结果不理想等问题。在数据库类型上,补充了DO、Reactome等新型数据库,解决了过往KEGG数据库信息不完善等问题,让重要的功能富集分析结果更为完善,有助于更好发现目标通路,快速锁定相关基因。



    2. 数据可视化:图形优化、图形动态修改

    好的数据呈现会提高读者对研究的理解深度,同时高超的绘图水平会让人对科研工作者的工作细致度带来更高的评价。与千篇一律的流程数据图相比,基迪奥更注重于个性精美图形的开发。我们新提供的转录组解决方案中,包含差异分析、富集分析、趋势分析等大量的个性图形,通过多维的图形呈现数据,有利于读者的快速阅读。同时优化了图形的设计方案,结合在线报告的图形绘制功能,能快速绘制出与大多数转录组图形不一样的图形风格,让文章结果更为个人化。











    更美观的图形呈现方式
    差异分析雷达图,富集分析圈图,韦恩图,小提琴图,火山图,富集气泡图

    3. 数据挖掘:线下流程与在线报告结合,数据挖掘更个性


    从方案形成到样本采集,再到测序和数据分析,最后形成文章产出等多个环节,数据分析是整个过程中最为个性化和难以处理的。对于与公司合作的客户来说,数据挖掘的人工成本非常高,这些往往是由于学习成本或沟通成本的累加造成。为解决这一难题,我们提出线下流程与在线报告结合的新解决模式。

    通过上面提到的新版线上流程,客户可以获得全面的转录组数据,得到最大限度的数据挖掘可能。然后结合在线报告,挖掘线下流程提供的数据,客户以几乎零学习成本的方式操作在线报告的多种数据分析工具,从而实现在一周内完成数据的二次精细挖掘的可能。

    在线报告动态数据挖掘:

    差异基本分析

    韦恩图分析

    趋势分析

    扫描二维码参与报名,送终身分析服务

    如果想体验这么优秀的转录组分析内容,可以扫一下二维码报名。对于成功预约项目的客户,我们承诺提供终身免费的在线报告个性数据挖掘服务,名额有限!


    活动最终解释权归基迪奥生物所有


    拓展阅读

    这么炫酷的图,竟然是富集分析结果?
    Omicsmart:大数据时代转录组分析该有的样子
                                    

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    图很酷炫!
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    好棒,感觉这个工具会越来越火
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