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[动植物重测序] 请问有没有大佬遇到geneid不统一的情况做富集分析。

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  • TA的每日心情
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    [LV.4]偶尔看看III

    钵水母

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    发表于 2020.1.14 16:30:21 | 显示全部楼层 |阅读模式
    我在NCBI上下载的物种的GTF文件和gff文件,蛋白质序列注释得到的是蛋白质ID+KO号,发现geneid有2种类型,一种是2B开头的短id, 一种是2RE开头的长ID,我利用官网的kegg工具做分析的时候,2BID+KO号出不了结果,2REID+KO号可以分析出来结果。  但是现在我不知道2REID对应的蛋白质ID是哪个,是可以直接一列2REID+KO号吗?   可以不用管对不对应。

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