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植物体内的细菌如何定量?

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    发表于 2016.7.14 10:02:26 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    如何定量植物体内,处理前后一种菌的变化。用qpcr的方法怎么去设计引物,用16s 区是否可行 ?
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    发表于 2016.7.23 01:18:10 | 显示全部楼层
    16s定量当然没有问题。但难度在于,你需要设计特异引物,否则你如何证明这个16s序列来自这种细菌而不是其他细菌?但16s的保守性很强,特异引物的设计可能比较困难。你可以考虑扩增其他这个细菌的特异基因,来实现定量。
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    发表于 2016.7.28 08:29:39 | 显示全部楼层
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     楼主| 发表于 2016.8.14 16:47:59 | 显示全部楼层
    基迪奥-周煌凯 发表于 2016.7.23 01:18
    16s定量当然没有问题。但难度在于,你需要设计特异引物,否则你如何证明这个16s序列来自这种细菌而不是其他 ...

    谢谢周老师,菌株的引物以设计好了,试过是可以用的。就是还没找到好的内参基因。对于这个有什么好的建议吗?
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