首页 >   >热点研究——翻译组介绍与应用

课程-热点研究——翻译组介绍与应用
翻译组测序(简称Ribo-seq)是一种通过检测与核糖体结合的RNA片段丰度,精确获得样本中所有可翻译分子瞬间翻译量的技术。翻译组测序作为一种精确定量翻译丰度的技术,由于实验难度大,至今依然是高分文章的利器。除了精确定量翻译丰度,翻译组测序还有其他更强大的功能。
  • 好评度 5 3
  •       
价格: 免费  VIP会员优惠细则

对于从事分子生物学研究的你来说,基因表达的定量信息是最基础的数据之一。基因表达定量,最常见的定量方法是转录组和蛋白质组。


图1 我们钟爱的中心法则其实是个很复杂的过程


最常见的,我们会用转录组进行定量。这等同于我们默认了一个信息:基因的mRNA丰度≈ 蛋白丰度(基因的最终功能产物)。这显然是值得商榷的选择。实际上,在细胞内部从mRNA到蛋白丰的过程,是个充满变数的过程。如下图来源一篇nature文章的结果。


(1)   如下图(a),蛋白半衰期中位数是46h,而mRNA仅仅为9h。

(2)   在平均丰度上,来源一个基因的mRNA分子在一个细胞内拷贝数的中位数是17,而蛋白却高达50,000(图b)。

(3)   在合成速率上,一个基因DNA分子平均一个小时仅仅可以合成数个mRNA分子(图c)。但蛋白合成却是踩足了油门,1个mRNA分子一个小时平均可以合成上百个蛋白分子,最高可以到上万(图d)。


图2 蛋白无论从半衰期、合成速率和分子数上与mRNA都存在数量级的差异。

(Schwanhausser B, Busse D, Li N, et al. Nature, 2011, 473(7347):337-342)


从这里我们可以看出,从mRNA到蛋白的翻译过程,还有大量变数。mRNA低丰度的基因,完全可以通过疯狂翻译产生大量蛋白分子,实现咸鱼翻身。mRNA高丰度的基因,如果在翻译阶段被踩一脚刹车,那么在蛋白阶段也可能跌入低谷。这就是翻译调控,可以在不改变转录丰度的前提下,快速应答从而改变蛋白的丰度。


这样部分解释了一个问题:转录组和蛋白组的相关性在实际项目里忽高忽低,难以琢磨?那是因为翻译调控在捣乱。


图3 转录组和蛋白组的相关性在实际项目可能会非常低


那么为什么不直接检测蛋白质组呢?蛋白质组也有不少缺点。由于质谱仪的局限性,蛋白质谱检测敏感度不够高,低丰度的基因难以被检测到。而且蛋白质谱的定量准确性,是低于测序的。


那么,是否有一种兼顾转录组和蛋白组优势的技术呢?有的,那就是翻译组。


翻译组测序,又被称为核糖体印记测序(Ribosome profiling sequencing,简称Ribo-seq)是一种通过检测与核糖体结合的RNA片段丰度,精确获得样本中所有可翻译分子(包括经典的mRNA和其他潜在可以翻译RNA分子)瞬间翻译量的技术。


图4 Ribo-seq 原理的示意图


翻译组测序作为一种精确定量翻译丰度的技术,自从2009年面世以来,已在数十种物种中开展了研究。由于实验难度大,至今依然是高分文章的利器。除了精确定量翻译丰度,翻译组测序还有其他更强大的功能。


暂无评价
暂无问答

直播须知
  • 1、请事先熟悉OmicShare在线交流课堂听课流程,注意开课时间,建议直播前半小时进入课堂,等待课程直播。
  • 2、建议首选联通、电信4M以上独享网络,上课时建议用网线非WIFI连接,避免直播卡顿,无法进入直播等情况。
  • 3、OmicShare直播课程视频仅供OmicShare注册用户学习使用,未经OmicShare许可以拷贝、录屏、反向工程、技术下载等手段获取直播课程视频的行为构成侵权,OmicShare立即封号处理,并保留追究法律责任的权力。
  • 4、如有问题可邮件omicshare@genedenovo.com或加入生物信息交流群QQ 154447756,与OmicShare客服及时取得联系。

授课老师

周老师 金牌讲师

公告

暂无公告

最新学员

学员动态

靳容 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

zm1114654882 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

calean 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

foxlily 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

foxlily 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(下)

xinyang3856 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(下)

zkf123 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

zkf123 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(下)

欢乐豆123 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

xinyang3856 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

xc13823320821 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

animalack 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

wpjtea 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

wh 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(下)

wh 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)

yuan620 开始学习 翻译组-连接mRNA与蛋白的桥梁(上)


© 2015 - 2019 OmicShare 版权所有 粤ICP备12019869号-1  广州基迪奥生物科技有限公司